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  • MSAP

    发布时间 :2022-08-19浏览次数:3005

    甲基化敏感扩增多态性 ,它是在扩增片段长度多态性技术的基础上建立起来的 。MSAP技术相对其他测定DNA甲基化程度技术有如下优点:

    (1)不需知道被测DNA的序列信息,在不同生物上具有通用性,可用于DNA序列背景知识未知的生物 。

    (2)操作相对简便,在AFLP技术体系的基础上不需要太大改进 ,即可操作 。

    (3)可在全基因组范围检测CCGG位点的胞嘧啶甲基化变化。MSAP技术的局限性在于不能完成非CCGG位点的胞嘧啶甲基化。

    MSAP的选择扩增产物目前主要通过两种方法进行分离检测,传统的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)的方法和自动化程度较高的毛细管凝胶电泳(FISH)进行检测 。

    PAGE方法主要是优点是引物可以是普通引物 ,适用于少量样本或者大量样本的引物筛选比较合适,另外还可以对差异条带进行克隆测序,获得差异条带的序列信息。

    毛细管电泳检测方法的优点是自动化,可以对大量样本进行实验  ,速度快 ,后期的条带读取可以依靠软件 ,降低了人为读取的标准不一 。

    1)MSAP服务内容

    1 样本基因组DNA的提取

    2 筛选多态性较好的引物(酶切 ,预扩,选择性扩增)

    3-1 在ABI3730xl测序仪上完成数据采集

    3-2 或是在JY-CX2B型 测序电泳槽上完成PAGE 检测(可以回收差异带)

    数据分析 :和客户详细沟通,确认分析方案:读取01矩阵,PAGE胶建议客户自己读取;

    2)客户提供:

    ★ 基因组DNA :

    ●至少15μL样品,浓度为50-100ng/μL;

    ●2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解;

    ●DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;

    ●DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里;

    ●DNA溶解后,肉眼看不到杂色;

    ★ 植物材料: 新鲜组织,叶片采用硅胶干燥后或干冰运输;

    ★ 动物材料: 新鲜组织,无水乙醇封存低温运输;

    3)试验费用:


    MSAP 毛细管电泳检测按照96个样本进行随机8对引物计算 ,提供01矩阵
    项目单价数量金额
    DNA提取30962880
    引物30000
    酶切401927680
    预扩151922880
    选择性扩增10153615360
    毛细管检测8001612800
    读带、分析

    议价
    合计

    41600
    MSAP PAGE电泳检测按照25个样本进行随机8对引物计算 ,提供PAGE胶图
    项目单价数量金额
    DNA提取3025750
    纯化1025250
    酶切40502000
    预扩1550750
    选择性扩增104004000
    PAGE检测80086400
    读带、分析

    议价
    合计

    14150

    MSAP1

    MSAP2



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